"龙山的居住者们在橡树之心力量的庇护下，一直幸福而和平的生活着。有一天，森林守卫者罗宾发现天气逐渐变冷，向森林之神需求帮助，森林之神给他派来了两个外形看似茄子的古灵精怪的小东西，罗宾为训练两个小东西很是头痛。  　　肯误打误撞来到了通往橡树之心的通道，看到了橡树之心正在逐渐消失，整个龙山也要被冰封。发现这一情况的肯急忙赶回去向龙山的长者汇报了这件事，长者推测这是冰冠堡垒的囚犯伊果坎的阴谋，需要肯来阻止他。  　　原来肯曾经是最强大的龙骑士，打败伊果坎后与爱妻过起了平凡的生活。肯的儿子阿尔菲正巧听到了这一消息，消除了对自己父亲的误会，还要帮忙一同拯救龙山。肯要打败伊果坎，必须拿到魔法剑—因辛米，所以肯和阿尔菲分头行动，肯直接去剑之森林，阿尔菲去找罗宾，然后他们在剑之森林汇合。冰冠堡垒看守者桂迪安有两个恶毒的仆人，他们妄想用冰封的力量统治世界，一次意外把伊果坎给放了出来。伊果坎赶走了两个仆人，拿走了桂迪安的魔法戒指，然后去剑之森林取得因辛米复仇。在剑之森林，肯与伊果坎相遇，两人展开了激烈的争斗，因为伊果坎取得了桂迪安的魔法戒指，所以肯不是他的对手，在生死存亡之际，阿尔菲带来了罗宾，拔出剑交给了肯，打败了伊果坎，龙山又恢复了往日的和平与繁荣。"

这是一个围绕着小提琴、有关父与子的故事… 这一次的敌人是以生命能量为食而生存的吸血鬼族中的Fungaia。与之战斗的人，便是在继承自父亲的工坊中制作小提琴的红渡。尽管依靠腰带的力量，他变身为假面骑士牙，但是对于自己为何能变身，为何不得不战斗，现在还尚未可知。然而，实际上，与Fungaia战斗的并非只有渡一个人。22年前，渡的父亲——音也已经从那时开始与猖獗的Fungaia战斗。 故事一边将渡所在的现在、以及22年前——年轻的音也结婚并生下名为渡的孩子之前——紧密地联系起来，一边发展。 22年前，音也未能铲除的Fungaia不断繁衍，并出现在现代的日本。渡化身为假面骑士牙，将其打倒，并以此形态将过去与现在相连。 然而，存在的并不仅仅只是双眼所能看到的形态。在各个时代生存着的人们的命运，将会与怎样的形态相连呢？为什么Fungaia的出现，会威胁到人类的存在呢？身在其中的渡和音也所背负的命运又是…？ 各种各样的人物，生活在各种各样的时代，故事正在发展。知道这2个时代的人，只有2个…那就是将Fungaia Hunter组织化的岛，以及22年前开始经营咖啡店「Coffee Mall Damour」的木户师傅。沉浮于2个时代的人们，掌握着他们命运关键的，是这2个人，还有父亲所留下的小提琴…！？